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合歡枯萎病一旦發生，很難治愈，因此應把工作重點放在預防上，制定綜合性的防控方案，防微杜漸。
首先要加強植物檢疫，嚴禁調運帶病苗木。從外地（包括區、縣）調運苗木時，必須有當地檢疫部門開具的檢疫證書。
其次要確保適地適樹、加強養管。合歡不耐水濕，要選在地勢較高、排水良好的沙壤土中栽植。苗木種植前應對土球做消毒殺菌處理，栽植后要加強肥水管理，提高植株生長勢，注意抗旱排澇。盡量少剪枝，剪枝后必須立即涂傷口保護劑。如果發現病株有超過1/3的枝干存在葉子發黃、干枯脫落時，應立即清除病株。
在群植合歡區域，一旦發現病株，應立即清除，以免傳播病菌。枯枝、病株和枯死株清除后，要集中銷毀，同時還應在樹穴及周圍相鄰土壤澆灌40%福美砷50倍液、可殺得2000倍液，或者用30%惡霉靈500倍液處理土壤，進行殺菌消毒，防止病菌蔓延。在發病區域不再補植合歡，應更換其他樹種。在對病株進行修剪作業時，每一單株使用過的剪刀、手鋸、鋤頭等園林工具，必須立即消毒，可在福爾馬林中浸泡10分鐘，然后進行下一單株的操作，以免相互感染，擴大病區。
最后是科學的藥劑防治。藥劑防治是防控合歡枯萎病的重要一環，防控重點應放在近些年新移栽的合歡樹上，針對不同情況采取相應的措施。
在未發病區域，對于生長健壯的苗木，暫不作藥劑防治處理，對于那些生長勢弱的苗木，應對樹冠和樹干部位作藥劑預防處理。對發病區域的全部合歡苗木，均應作根部灌藥和枝干噴藥防治處理。枝干噴藥可選擇23%絡氨銅水劑250～300倍液、25%敵力脫乳油800倍液、20%抗枯靈水劑400～600倍液等。為避免樹木產生抗藥性，各種藥物應交替使用，每隔7～10天復噴1次，需連續噴2～4次。根部灌藥建議用30%惡霉靈500倍液或可殺得2000倍液澆灌，在樹冠投影區施用，每平方米澆2～4公斤藥液，每10天澆1次，連續澆3～4次，亦應注意交替用藥。灌根和枝干噴藥均應在合歡葉芽萌動初期使用
首先要加強植物檢疫，嚴禁調運帶病苗木。從外地（包括區、縣）調運苗木時，必須有當地檢疫部門開具的檢疫證書。
其次要確保適地適樹、加強養管。合歡不耐水濕，要選在地勢較高、排水良好的沙壤土中栽植。苗木種植前應對土球做消毒殺菌處理，栽植后要加強肥水管理，提高植株生長勢，注意抗旱排澇。盡量少剪枝，剪枝后必須立即涂傷口保護劑。如果發現病株有超過1/3的枝干存在葉子發黃、干枯脫落時，應立即清除病株。
在群植合歡區域，一旦發現病株，應立即清除，以免傳播病菌。枯枝、病株和枯死株清除后，要集中銷毀，同時還應在樹穴及周圍相鄰土壤澆灌40%福美砷50倍液、可殺得2000倍液，或者用30%惡霉靈500倍液處理土壤，進行殺菌消毒，防止病菌蔓延。在發病區域不再補植合歡，應更換其他樹種。在對病株進行修剪作業時，每一單株使用過的剪刀、手鋸、鋤頭等園林工具，必須立即消毒，可在福爾馬林中浸泡10分鐘，然后進行下一單株的操作，以免相互感染，擴大病區。
最后是科學的藥劑防治。藥劑防治是防控合歡枯萎病的重要一環，防控重點應放在近些年新移栽的合歡樹上，針對不同情況采取相應的措施。
在未發病區域，對于生長健壯的苗木，暫不作藥劑防治處理，對于那些生長勢弱的苗木，應對樹冠和樹干部位作藥劑預防處理。對發病區域的全部合歡苗木，均應作根部灌藥和枝干噴藥防治處理。枝干噴藥可選擇23%絡氨銅水劑250～300倍液、25%敵力脫乳油800倍液、20%抗枯靈水劑400～600倍液等。為避免樹木產生抗藥性，各種藥物應交替使用，每隔7～10天復噴1次，需連續噴2～4次。根部灌藥建議用30%惡霉靈500倍液或可殺得2000倍液澆灌，在樹冠投影區施用，每平方米澆2～4公斤藥液，每10天澆1次，連續澆3～4次，亦應注意交替用藥。灌根和枝干噴藥均應在合歡葉芽萌動初期使用
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