該中心包括組培快繁中心、煉苗區及脫毒原種圃三個部分，既功能獨立又布局統一。東側組培中心為兩層樓體結構，面積7200平方米，是集科研、教學和生產于一體的現代化組培室和多功能綜合實驗室，用于果樹育種、良種脫毒、快速繁育及病毒檢測。西側煉苗區為現代化玻璃溫室，面積3600平方米，采用智能控制系統，調節溫室的溫濕度，主要用于組培苗的煉苗，使其定植后能夠迅速適應陸地的不良環境條件，縮短緩苗時間，增強對低溫、大風等的抵抗能力。

　　煙臺農科院采用高溫熱處理、化學處理、超低溫保存結合微莖尖剝離技術等一套組合式脫毒技術，對蘋果砧木和品種脫毒技術和工廠化育苗技術進行了研究，建立了蘋果砧穗病毒脫除、病毒檢測、組培快繁、生根、溫室煉苗移栽等一整套無病毒苗木工廠化繁育技術體系，獲得脫毒砧木嫁接脫毒品種，真正實現了蘋果雙脫毒苗木的繁育。2014年至2019年累計繁育煙富3號、2001富士、太平洋嘎拉、紅露等蘋果雙脫毒苗木752萬株，繁育脫毒接芽8603萬個。

　　煙臺蘋果脫毒種苗繁育中心擁有蘋果病毒脫除與檢測、無病毒原種保存、無病毒原種圃、無病毒采穗圃和無病毒苗木生產園等一整套完整的果樹無病毒苗木繁育體系。建立了APSV、ACLSV和ASGV等3種病毒同時檢測的多重RT-PCR檢測體系，顯著提高了病毒檢測效率，準確率達到98%以上。煙臺農科院培育的脫毒苗木對老果園更新換代改造具有明顯優勢：樹勢生長旺盛、抗病性強、耐重茬、果個大、商品果率高，成為煙臺地區老果園更新改建的首選苗木。